Унутрашња контрола ВОА врши контролу законитости рада и примене овлашћења њених припадника.
Унутрашња контрола се врши ради редовног праћења стања законитости у раду и примени овлашћења припадника ВОА, припремању аката и налога, оцени законитости спровођења прописаних процедура и поступака из делокруга рада и решавања по поднетим предлозима и представкама, као и притужбама о угрожавању људских права и слобода у случајевима незаконитог поступања.